MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 10424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011528	TTTCT	2	10	53	62	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011528	CCCCT	2	10	1513	1522	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3	NC_011528	G	6	6	1628	1633	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011528	TAGA	2	8	3919	3926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011528	AGA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011528	AAT	2	6	4016	4021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011528	A	7	7	4032	4038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011528	A	7	7	4078	4084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011528	TCC	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_011528	A	10	10	6756	6765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011528	TG	3	6	6825	6830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011528	TGA	2	6	6835	6840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011528	GTAT	2	8	6883	6890	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011528	GTG	2	6	6920	6925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011528	GGA	2	6	6938	6943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011528	GCA	2	6	7003	7008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011528	AAC	2	6	7116	7121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011528	GTT	2	6	7198	7203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011528	GTG	2	6	7230	7235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011528	AGCG	2	8	7270	7277	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011528	TTGT	2	8	7318	7325	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011528	TTG	2	6	7334	7339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011528	GAG	2	6	7367	7372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011528	GGGT	2	8	7431	7438	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011528	TCA	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011528	ACA	2	6	7534	7539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011528	AGG	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011528	TGT	2	6	7560	7565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011528	A	6	6	7642	7647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011528	GAAT	2	8	7698	7705	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011528	TG	3	6	7712	7717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011528	GTG	2	6	8754	8759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011528	CGT	2	6	8781	8786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011528	TAT	2	6	8809	8814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011528	G	7	7	8845	8851	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011528	GC	3	6	9044	9049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011528	GC	3	6	9061	9066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011528	GC	3	6	9072	9077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011528	CT	3	6	14648	14653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011528	TCC	2	6	14704	14709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011528	A	6	6	14749	14754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011528	A	7	7	14905	14911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011528	A	6	6	14971	14976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011528	T	7	7	15009	15015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011528	ACT	2	6	15032	15037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011528	TAAA	2	8	15056	15063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011528	A	6	6	15102	15107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011528	TGCGC	2	10	17784	17793	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_011528	GC	3	6	17801	17806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011528	GC	3	6	17818	17823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011528	C	6	6	18016	18021	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_011528	AAT	2	6	18051	18056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011528	GAC	2	6	18079	18084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011528	CAC	2	6	18107	18112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_011528	GGGT	2	8	18113	18120	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011528	AG	3	6	18169	18174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011528	T	6	6	18255	18260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011528	TCA	2	6	23091	23096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011528	AGC	2	6	23146	23151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011528	CGA	2	6	23161	23166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011528	TTTA	2	8	23208	23215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011528	CTG	2	6	23223	23228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011528	A	8	8	23293	23300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011528	A	6	6	23326	23331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011528	TAA	2	6	23344	23349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011528	TAA	2	6	23356	23361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011528	TTAAT	2	10	23376	23385	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011528	TAGT	2	8	23393	23400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011528	GCGAA	2	10	23424	23433	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011528	TTG	2	6	23445	23450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011528	GCTTC	2	10	25984	25993	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_011528	TTG	2	6	26015	26020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011528	AG	4	8	26033	26040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011528	GCA	2	6	26058	26063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011528	CAG	2	6	26227	26232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011528	TGT	2	6	26235	26240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011528	GGA	2	6	26269	26274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011528	A	6	6	28566	28571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011528	TAT	2	6	28575	28580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011528	T	8	8	28582	28589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011528	A	7	7	28598	28604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011528	GTT	2	6	28628	28633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011528	ATT	2	6	28677	28682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011528	TTG	2	6	28698	28703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011528	CGA	2	6	28714	28719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011528	CAG	2	6	28736	28741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011528	GAAA	2	8	28742	28749	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011528	GA	3	6	35763	35768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011528	A	8	8	35768	35775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011528	CGCTT	2	10	35786	35795	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_011528	A	6	6	35811	35816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011528	T	6	6	35839	35844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011528	A	6	6	35859	35864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011528	ATT	2	6	35920	35925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011528	CGTT	2	8	35930	35937	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011528	GCT	2	6	35941	35946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011528	T	7	7	36045	36051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011528	TGT	2	6	36131	36136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011528	T	6	6	36221	36226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011528	TTG	2	6	36398	36403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011528	CAA	2	6	36471	36476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011528	AAC	2	6	36516	36521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011528	AAG	2	6	36555	36560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011528	CGC	2	6	36634	36639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_011528	TGC	2	6	36697	36702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011528	GAT	2	6	36734	36739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011528	GGC	2	6	36877	36882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011528	TGG	2	6	36987	36992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011528	GGC	2	6	37061	37066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011528	TTC	2	6	37076	37081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011528	AGC	2	6	37098	37103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011528	A	8	8	37441	37448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011528	T	6	6	38143	38148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011528	A	6	6	38149	38154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011528	C	6	6	41505	41510	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_011528	CTATC	2	10	41514	41523	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_011528	CACC	2	8	41526	41533	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_011528	ACG	2	6	41758	41763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011528	AAC	2	6	41793	41798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011528	TAA	2	6	41966	41971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011528	GAT	2	6	41983	41988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011528	TCT	2	6	41995	42000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011528	ACG	2	6	42030	42035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011528	TC	3	6	42051	42056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011528	ATT	2	6	42081	42086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011528	CAA	2	6	42090	42095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011528	T	6	6	42141	42146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011528	TGTT	2	8	42214	42221	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011528	A	6	6	42239	42244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011528	TTC	2	6	42255	42260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011528	GTA	2	6	42356	42361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011528	CGT	2	6	42437	42442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011528	TA	4	8	42450	42457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011528	T	7	7	42597	42603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011528	GCTT	2	8	42777	42784	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011528	ACC	2	6	42842	42847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_011528	TTC	2	6	42855	42860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011528	CCA	2	6	42879	42884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_011528	TCA	2	6	42904	42909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011528	ATTGG	2	10	42924	42933	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011528	TTCT	2	8	42947	42954	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011528	TTG	2	6	43360	43365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011528	AGT	2	6	43380	43385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011528	CTT	2	6	44605	44610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_011528	T	6	6	44629	44634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011528	TAT	2	6	44639	44644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011528	T	8	8	44669	44676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011528	TC	3	6	44681	44686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_011528	AAG	2	6	45978	45983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011528	CGT	2	6	46307	46312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_011528	GC	3	6	46334	46339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_011528	ATA	2	6	46404	46409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011528	GC	3	6	49050	49055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_011528	GC	3	6	49059	49064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_011528	TTC	2	6	49070	49075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_011528	CGA	2	6	51474	51479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_011528	TCAA	2	8	51524	51531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
160	NC_011528	AAG	2	6	51575	51580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_011528	AAG	2	6	53455	53460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011528	CAT	2	6	53483	53488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_011528	GC	3	6	53609	53614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
166	NC_011528	A	6	6	54077	54082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_011528	TCC	2	6	55375	55380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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185	NC_011528	CGT	2	6	60626	60631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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197	NC_011528	T	6	6	62897	62902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_011528	AGT	2	6	62914	62919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_011528	AG	3	6	111942	111947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_011528	GCG	2	6	112196	112201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_011528	TAA	2	6	112212	112217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_011528	TAT	2	6	112235	112240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_011528	CAA	2	6	118450	118455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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466	NC_011528	TTA	2	6	119062	119067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_011528	TGG	2	6	119093	119098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_011528	A	6	6	119443	119448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_011528	A	6	6	119484	119489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_011528	TGTC	2	8	122323	122330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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